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Subio 2.0に向けたお願い

  • By: tshimizu
  • Date: 2010-09-02 13:24:32
  • Tags:

いつもありがとうございます。
発現アレイ解析から最近ではゲノムCGHまでこれ一つで色々と解析できるので本当に重宝しています。

さて、次のメジャーバージョンアップに向けて、いくつか追加していただきたい機能がありますので、ご検討下さい。

1)複数のMeasurement listを簡単に一つにまとめたい。
シリーズを作成するたびに、データセットに共通するMeasurement listをインポートし直すのが結構面倒なので、データセット固有のリストを指定できるようにするか、もしくは他のデータセットの中にあるリストをフォルダごとインポートできると大変助かります。

2)すでにあるシリーズに新しくデータを追加する。
上記と関連するのですが、追加するのは大変難しいようなので、1)が可能になればそれで対応できるかもしれません。

3)Analysisi browserでGenome viewを使う際に、Processed viewとCh1 rawの他に、Ch2 rawも見えるようにしていただきたい。
CGHは2色法での解析が中心なので、そのうちの1色しかraw dataを見ることが出来ないと少々不便です。

4)Annotationタブで複数のMeasurement IDを一度に選びたい。
Shift+クリックで範囲を選べたり、Ctrl+クリックで選択していければ大変ありがたい。

5)Treeクラスタリングでサンプルツリー無しのクラスタリングができないでしょうか?要はデータセットの表示順を固定してクラスタリングした結果を得たいのですが。

6)シリーズをロードした際に、genome viewで結果が表示されない場合がある。
時々起きますので、何かの際に確認いただけるとありがたいです。

どうぞよろしくお願いします。

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