Log Ratioのデータをインポートした場合
- By: tabukov@subio
- Date: 2010-04-01 18:53:20
Symptom:
Log Ratioの(対数に変換された比の値)データをインポートして、Subio Platformで視覚化した場合、Subio Platform上でノーマライズをしなくても、グラフの軸設定をLinearモードで表示するだけで適切な表示になります。
ただし、このままではBasic Plug-inのCompare to ControlやCompare 2 Groupsが適切に動作しません。負数(比が1より小さい)のとき、大小が逆転してしまいます。
* Log Ratioのデータだと意識していなくても、たとえばRMAやGC-RMAなどで数値化されたデータであれば底が2のLog Ratioデータである可能性が高いです。
Workaround:
Subio Platformにデータが対数であることを知らせるために、"Import Log Ratio Data"というノーマライズブロックを適用してください。これによって、値が対数だと正しく認識できれば、プラグインは正常に動作します。




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